Éditeur(s) : EDP Sciences
Résumé : Bonamiosis is a parasitic disease (causative agent: Bonamia ostreae) affecting the European flat oyster Ostrea edulis, responsible for a drastic decline in its aquaculture production. Selective breeding programs for resistance to bonamiosis have been undertaken to counter this disease. In the present study, a 6-month cohabitation challenge experiment was performed in order to transmit the disease from wild oysters injected with the parasite to two tested families of oysters (20 and 8-month old at the beginning of the experiment, with different genetic backgrounds) originating from a selective breeding program developed by IFREMER in France. Mortalities were checked daily and ventricular heart smears were performed on dying or moribund oysters to detect the level of infection by B. ostreae. Mortality started after 4 months of cohabitation in the tested oysters. The cumulative mortalities after 6 months were 58% for the wild oysters, 9% for Family 1 (20-month old) and 20% for Family 2 (8-month old). In the dying oysters, the parasite could be detected in 67% of the wild oysters, 68% of Family 1 and 89% of Family 2. It was detected in only 11% of the surviving oysters of Family 2. The mortality and the level of infection by the parasite were significantly higher in Family 2 than in Family 1. Our results demonstrate that prespawning oysters as young as 1 year-old can become infected with the parasite and, most importantly, can die from bonamiosis. This result is inconsistent with the commonly accepted critical age of 2 years-old for the disease development. Additionally, no clear relationship between shell length and level of infection was observed. We also review the different methods for infection of the European flat oyster O. edulis with B. ostreae under experimental conditions and their main results.
La bonamiose est une maladie parasitaire (agent causal : Bonamia ostreae) affectant l'huître plate européenne Ostrea edulis, responsable d'un déclin drastique de sa production aquacole. Des programmes de sélection pour la résistance à la bonamiose ont été entrepris pour contrer cette maladie. Dans cette étude, une expérience de 6 mois d'infection par cohabitation a été réalisée de manière à transmettre la maladie à partir d'huîtres sauvages injectées avec le parasite vers deux familles testées d'huîtres (âgées de 20 et 8 mois en début d'expérience, avec des origines génétiques différentes) issues du programme de sélection développé par IFREMER en France. Les mortalités ont été vérifiées quotidiennement et des frottis de coeur ventriculaire réalisés sur les huîtres mortes ou moribondes pour détecter le niveau d'infection par B. ostreae. La mortalité a commencé chez les huîtres testées après 4 mois de cohabitation. Les mortalités cumulées après 6 mois étaient de 58 % chez les huîtres sauvages, 9 % chez la Famille 1 (âgées de 20 mois) et 20 % chez la Famille 2 (âgées de 8 mois). Chez les huîtres mourantes, le parasite a pu être détecté chez 67 % des huîtres sauvages, 68 % de la Famille 1 et 89 % de la Famille 2. Il n'a pu être détecté que chez 11 % des huîtres survivantes de la Famille 2. La mortalité et le niveau d'infection par le parasite étaient significativement plus élevés chez la Famille 2 que chez la Famille 1. Nos résultats démontrent que des huîtres âgées de un an peuvent devenir infectées par le parasite et surtout, peuvent mourir de bonamiose. Ce résultat contraste avec l'âge critique de développement de la maladie communément accepté de 2 ans. De plus, aucune relation claire entre la longueur de la coquille et le niveau d'infection n'a été observée. Nous faisons également la revue des différentes méthodes d'infection de l'huître plate européenne O. edulis avec B. ostreae en conditions expérimentales et leurs principaux résultats.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 2008-12 , Vol. 21 , P. 423-439

Droits : EDP Sciences, IFREMER, IRD 2008
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4783.pdf
DOI:10.1051/alr:2008053
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4783/

Éditeur(s) : Rome : Vitale Mascardi
Résumé : "Les 5 premières parties (vol. 1 et vol. 2) ont une pagination continue. Le traité de Hernandez, à la fin du volume 2, a seul une pagination spéciale. Titre en rouge et noir, avec vignette gravée sur cuivre. Nombreuses figures sur bois dans le texte de plantes, animaux et minéraux. - Reliure veau brun, dos à 6 nerfs, 17e siècle. - Cachet de la bibliothèque de la Ville de Bordeaux. Leclerc, 1154. - Palaü y Dulcet, 113 538. - Pritzel, 4000. - Sabin, 31516"
Siècle(s) traité(s) : 17
Droits : Domaine public
Provenance : Ville de Bordeaux. Bibliothèque municipale
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/BBX17012
BBX17012

Éditeur(s) : Physiomar 08 Physilogical aspects of reproduction, nutrition and growth "Marine molluscs in a changing environment"
Résumé : Bonamiosis is a parasitic disease (causative agent: Bonamia ostreae) affecting the European flat oyster Ostrea edulis, responsible for a drastic decline in the aquaculture production of this oyster species. Therefore a selective breeding program for resistance to bonamiosis has been undertaken since 1985 bu Ifremer, leading to the production of several selected oyster families. In the present study, a 6-month cohabitation challenge experiment was performed in order to transmit the disease from wild oysters (injected with the parasite) to two tested families of oysters originating from the selective breeding program. Mortalities were checked daily, and ventricular heart smears were performed on dying or moribund oysters to detect the level of infection to B. ostreae. The first infections occurred after 4 months of challenge in the tested oysters (Family 1 and Family 2). The cumulative mortalities after 5 monts were 58% for the wil oysters, 9% for Family 1 (20-month old at the beginning of the experiment) and 20% for Family 2 (8-month, old). The parasite could be detected in 66.8% of the dying wild oysters, 67.5% of the dying oysters of Family 1, 89% of the dying oysters of Family 2 and only 11% of the surviving oysters of Family 2. The mortality was significantly higher in Family 2 thant in Family 1 (x2= 20.87, p<0.001, d.f.) as well as the level of infection by the parasite found in heart smear (x2=24.34, p<0.001, 4 d.f.). This result demonstrates that prespawning oysters as yong as 1 year-old can become infected with the parasite and die from bonamiosis. This result is inconsistent with the commonly accepted critical age of 2 years-old for the disease development. The most probable cause of the dscrepancy in the development of bonamiosis between the 2 tested families is a difference in genetic background.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/acte-4535.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4535/

Éditeur(s) : Institut national agronomique Paris Grignon
Résumé : The flat oyster Ostrea edulis L. is the indigenous oyster of the Atlantic as well as the Mediterranean coasts of Europe. Its commercial exploitation dates back to Antiquity but its breeding is now threatened by two parasitic protozoa, among which Bonamia ostreae. Various aspects of the genetics of this species' natural and farmed populations have been studied with the aid of microsatellite markers. At first, the implementation and the screening of two partial genomic libraries made it possible to identify 28 new microsatellite loci. Analysis of the segregation of 12 of these loci and of two enzymatic loci shows that most microsatellite loci are transmitted in a Mendelian way, but some loci have significant segregation distortions. Moreover, seven linkage groups, of which four contain at least two markers, were identified in Ostrea edulis. The genetic variability of three populations selected for one or two generations for resistance to Bonamia ostreae was analysed with the aid of 5 microsatellite loci. In spite of the absence of genealogical data, we have shown that these selected populations were descended from a very low number of founding genitors (from 3 to 15 depending on the population) and for two populations, we were able to reconstruct the genealogy and the relationships between the individuals were identified. These selected populations have, in addition to a very low genetic variability, real and at times high levels of consanguinity. These results have a significant implication for the continuation of the selection programme (consanguinity management, augmentation of genetic variability by introducing wild genitors). The geographical structuring of the genetic variability of natural populations of Ostrea edulis has been analysed with the aid of 5 microsatellite loci on a sampling covering almost the entire distribution area of the species (from Norway to the Adriatic Sea). The results are consistent with those published in the literature and using enzymatic markers. The populations show a low level of differentiation that could correspond to a model of isolation by distance. The Atlantic populations, which have a reduced polymorphism, could be descended from post-glacial recolonisation from Mediterranean populations that had survived the glaciations of the Quaternary Period. The current distribution of flat oyster populations is surely also subject to anthropogenic activities. Finally, the genetic bases of the heterozygosis-growth correlation were studied in a natural population with the aid of enzymatic and microsatellite markers. Although leads favouring the direct contribution of enzymatic loci have been found, biases in the sampling design make it impossible to come to a formal conclusion. However, this study has made it possible to show that the capture of individuals over a short period (around ten days) leads to a sampling of a population descended from a very low number of founding genitors, in contradiction with the generally accepted idea that marine bivalve populations are large panmictic populations with significant, efficient numbers. These results confirm in a natural population the observations of a significant reduction of efficient sizes in hatchery populations.
L'huître plate Ostrea edulis L. est l'huître indigène des côtes européennes aussi bien atlantiques que méditerranéennes. Son exploitation commerciale remonte à l'Antiquité mais son élevage est aujourd'hui menacé par deux protozoaires parasites dont Bonamia ostreae. Différents aspects de la génétique des populations naturelles et cultivées de cette espèce ont été étudiés à l'aide de marqueurs microsatellites. Dans un premier temps, la réalisation et le criblage de deux banques génomiques partielles ont permis l'identification de 28 nouveaux locus microsatellites. L'analyse de la ségrégation de 12 de ces locus et de deux locus enzymatiques montre que la plupart des locus microsatellites sont transmis de façon mendélienne, mais certains locus présentent des distorsions de ségrégation importantes. Par ailleurs, sept groupes de liaison dont quatre contiennent au moins deux marqueurs ont été identifiés chez Ostrea edulis. La variabilité génétique de trois populations sélectionnées depuis une ou deux générations pour une résistance à Bonamia ostreae a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites. Malgré l'absence de données généalogiques, nous avons montré que ces populations sélectionnées étaient issues d'un très faible nombre de géniteurs fondateurs (de 3 à 15 selon les populations) et pour deux populations, la généalogie a pu être reconstituée et les liens de parenté entre les individus ont été identifiés. Ces populations sélectionnées présentent, outre une très faible variabilité génétique, des niveaux de consanguinité réels et parfois élevés. Ces résultats ont une implication importante pour la continuation du programme de sélection (gestion de la consanguinité, augmentation de la variabilité génétique par introduction de géniteurs sauvages). La structuration géographique de la variabilité génétique des populations naturelles d'Ostrea edulis a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites sur un échantillonnage couvrant presque toute l'aire de répartition de l'espèce (de la Norvège à la Mer Adriatique). Les résultats sont cohérents avec ceux publiés dans la littérature et utilisant des marqueurs enzymatiques. Les populations montrent un niveau de différenciation faible qui pourrait correspondre à un modèle d'isolement par la distance. Les populations atlantiques, qui présentent un polymorphisme réduit, pourraient être issues de recolonisation post-glaciaire à partir de populations méditerranéennes ayant survécu aux glaciations du Quaternaire. La répartition actuelle des populations d'huître plate est certainement aussi soumise aux actions anthropiques. Enfin, les bases génétiques de la corrélation hétérozygotie-croissance ont été étudiées dans une population naturelle à l'aide de marqueurs enzymatiques et microsatellites. Bien que des pistes en faveur de la contribution directe des locus enzymatiques aient été trouvées, des biais dans le dispositif expérimental ne permettent pas de conclure de façon formelle. Cependant, cette étude a permis de montrer que le captage d'individus sur une faible période (une dizaine de jours) conduit à l'échantillonnage d'une population issue d'un nombre très réduit de géniteurs fondateurs, en contradiction avec l'idée reçue que les populations de bivalves marins sont de larges populations panmictiques à effectif efficace important. Ces résultats confirment dans une population naturelle les observations de réduction importante des tailles efficaces dans des populations d'écloserie.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/these-1919.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1919/

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Éditeur(s) : Paris : Société d'éditions géographiques, maritimes et coloniales
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA12007
FRA12007

Éditeur(s) : Lugdun. Batavorum : apud Franciscum Hackium Amsterdam : Elzevier
Résumé : "Titre gravé sur cuivre (f. *1) suivi du faux-titre imprimé (f. *2) : "Guilielmi Pisonis, M. D. Lugduno-Batavi, de medicina Brasiliensi libri quatuor: I. De aëre, aquis, & locis. II. De morbis endemiis. III. De venenatis & antidotis. IV. De facultatibus simplicium. Et Georgii Marcgravii de Liebstad, misnici germani, historiæ rerum naturalium Brasiliæ, libri octo: quorum tres priores agunt de plantis. Quartus de piscibus. Quintus de avibus. Sextus de quadrupedibus & serpentibus. Septimus de insectis. Octavus de ipsa regione, & illius incolis. Cum appendice de Tapuyis, et Chilensibus. Joannes de Laet, Antwerpianus, in ordinem digessit & annotationes addidit, & varia ab auctore omissa supplevit & illustravit". - La 2e partie est précédée du faux-titre : "Georgii Marcgravii de Liebstad, misnici germani, historiæ rerum naturalium Brasiliæ, libri octo: quorum tres priores agunt de plantis. Quartus de piscibus. Quintus de avibus. Sextus de quadrupedibus, et serpentibus. Septimus de insectis. Octavus de ipsa regione, & illius incolis. Cum appendice de Tapuyis, et Chilensibus. Joannes de Laet, Antwerpianus, in ordinem digessit & annotationes addidit multas, & varia ab auctore omissa supplevit & illustravit". - Épître dédicatoire au comte Maurice de Nassau Edition originale. - Frontispice gravé sur cuivre par Theodor Matham. - 436 bois dans le texte, d'après Georg Marcgrave et Albert Eckhout Imprimé à Leyde par Bonaventure et Abraham Elzevier, d'après Rahir. Sig. *6, A-P4, Q2 ; -4, A-Oo4, Pp2. - Demi reliure basane, 19e siècle. - Cachet de l'Académie royale de Bordeaux. - Cachet de la bibliothèque de la Ville de Bordeaux Borba de Moraes II, 675-6. - Garrison-Morton 5303. - Nissen BBI 1553. - Nissen IVB 589. - Rahir 1077. - Sabin 63028. - Willems 1068"
Siècle(s) traité(s) : 17
Droits : Domaine public
Provenance : Ville de Bordeaux. Bibliothèque municipale
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/BBX17010
BBX17010

Éditeur(s) : Paris : chez la Veuve Piget
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Archives territoriales de Guyane
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/GAD11005
GAD11005

Éditeur(s) : Academic Press Ltd- Elsevier Science Ltd
Résumé : Bonamiosis due to the parasite Bonamia ostreae has been associated with massive mortality in flat oyster stocks in Europe. Control of the disease currently relies on disease management practices and transfer restriction. Previously, massal selections based on survival to challenge to infection with B. ostreae have been applied to produce flat oyster families with resistant progeny. In an attempt to understand the molecular mechanisms involved in disease resistance, differentially expressed sequence tags between resistant and wild Ostrea edulis haemocytes, both infected with the parasite, were identified using suppression subtractive hybridisation. Expression of seven ESTs has been studied using quantitative reverse-transcriptase PCR. The base-line expression of an extracellular superoxide dismutase, inhibitor of apoptosis (OeIAP), Fas ligand (OeFas-ligand) and Cathepsin B was significantly increased, whilst cyclophilin B appeared significantly decreased in resistant oysters. Considering their great interest for further studies, the open reading frames of the OeFas-ligand and OeIAP were completely sequenced. Highlights ► Bonamia ostreae is an intra-haemocytes parasite. ► Flat oyster Ostrea edulis, is the natural host of B. ostreae. ► In this study we have studied genes expressed in response to the parasite. ► Extracellular superoxide dismutase (OeEcSOD) is up regulated in resistant haemocyte. ► Genes involved in apoptosis is up regulated in resistant haemocytes from flat oyster.
Fish & Shellfish Immunology (1050-4648) (Academic Press Ltd- Elsevier Science Ltd), 2012-06 , Vol. 32 , N. 6 , P. 958-968

Droits : 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00071/18218/15790.pdf
DOI:10.1016/j.fsi.2012.01.026
http://archimer.ifremer.fr/doc/00071/18218/

Éditeur(s) : Paris : Imprimerie Alcan-Lévy

Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11067
FRA11067

Éditeur(s) : Springer
Résumé : The great fecundity and very high larval mortality of most marine invertebrates and fish make possible substantial variance in the number of offspring contributed by adults to subsequent generations. The reproductive success of such organisms may thus resemble a sweepstakes lottery, in which a minority of progenitors succeeds in replacing an entire population, while the majority fails to procreate. One specific prediction of this hypothesis, that genetic diversity of newly settled cohorts should be less than that of the adult population, is tested in the present study. Microsatellite DNA markers were examined in naturally spawned juvenile European flat oysters Ostrea edulis (L.), collected over a 12-day period in 1993 from the western Mediterranean Sea, near Sete, France (43 degrees 32'N, 3 degrees 56'E) and grown out for a period of up to 10 months. Variation in these juveniles was compared to that in a pooled sample of adults collected in 1994 from two locations (Thau Lagoon and Port St. Louis) that had statistically homogeneous allelic frequencies. Though nearly twice as large as the pooled adult sample, the juvenile sample had only 60% of the adult allelic diversity. Analyses of linkage disequilibrium and kinship, as well as estimation of the effective number of parents, suggested that 10-20 adults produced this juvenile cohort. This observation supports the hypothesis of sweepstakes reproductive success and suggests that partial inbreeding may occur even in species with large populations and dispersing planktonic larvae.
Marine Biology (0025-3162) (Springer), 2007-03 , Vol. 150 , N. 6 , P. 1173-1182

Droits : 2007 Springer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2616.pdf
DOI:10.1007/s00227-006-0441-y
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2616/

Éditeur(s) : Styli 2003. Trente ans de crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Nouméa - Koné, 2-6 juin 2003. 2004. Gorarant C, Harache Y, Herbland A, Mugnier C. Ed. Ifremer, Actes de Colloque, n°38, pp.113-120
Résumé : Two oyster species are currently present along the French coasts : the indigenous European flat oyster (Ostrea edulis), and the Pacific cupped oyster (Crassostrea gigas), that has been introduced from Japan since the beginning of the 70ies. The flat oyster successively suffered from two protozoan diseases during the 60ies and its production decreased from 20 000 tons/year by that time to 1 500 tons/year nowadays. Consequently, the oyster production is principally (99%) based upon the Pacific oyster species with approximately 150 000 tons/year among which 90% are grown from the natural spat. However, the hatchery production of this species is developing and was estimated to 400 to 800 millions spat in 2002. Moreover, strengthened relationships between IFREMER and the 5 commercial hatcheries, that all joined the SYSAAF (Union of the French poultry, shellfish and fish farming selectors), allow to plan for new genetic breeding programs. At the end of the 80ies, IFREMER initiated a genetic breeding program for the resistance of the European flat oyster to the bonamiosis, and obtained strains more tolerant to this disease. After two generations of massal selection, molecular markers had identified a reduced genetic basis in this program. It was then reoriented to an intra-familial selection. However, we were confronted to a zootechnic problem to manage such a scheme and we compromised by an intra-cohorts of families selection scheme managed using molecular markers. The program has now reached the transfer level with experimentation at a professional scale. Concerning the Pacific cupped oyster, and in parallel with the obtaining and the study of polyploids, performance of different Asian cupped oyster strains were compared to the one introduced in France thirty years ago and currently suffering from summer mortalities. The local strain exhibited better performance, certainly based upon a good local adaptation. In other respects, although early growth is a relevant criteria for selection for growth to commercial stage, it is not to be privileged in the context of an oyster producing region with a limited food availability. Contrary, the spat summer mortality became a priority for numerous teams (genetic, physiology, pathology, ecology,...) joined in the MOREST program. The first results showed important survival differences between fullsib and halsib families. They indicate a genetic determinism to this character "survival" and promote for its selection.
Deux espèces d'huîtres sont aujourd'hui présentes sur les côtes françaises : l'huître plate européenne (Ostrea edulis), indigène, et l'huître creuse du Pacifique (Crassostrea gigas), introduite du Japon dans le début des années 1970. L'huître plate a subi coup sur coup, dans les années 1960, deux maladies dues à des protozoaires parasites et sa production est ainsi passée de 20 000 t/an dans les années 1960 à 1500 t/an aujourd'hui en France. Il en résulte que la filière ostréicole française repose quasiment exclusivement (99%) sur la production de l'huître creuse, C. gigas, avec 150 000 tonnes en 2000 dont environ 90% est issu du captage naturel. Cependant, la reproduction de cette espèce en écloserie est actuellement en expansion avec une estimation de 400 à 800 millions de naissains commercialisés en 2002. Des rapports renforcés entre l'IFREMER et les cinq écloseries françaises de la filière ostréicole, qui adhèrent toutes au SYSAAF (SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), permettent désormais d'envisager le développement de nouveaux programmes d'amélioration génétique. A la fin des années 1980, un programme de sélection pour la résistance de l'huître plate à la bonamiose a été initié au sein de l'IFREMER, et a permis d'obtenir des souches plus tolérantes à cette maladie. Après deux générations en sélection massale, les marqueurs moléculaires avaient mis en évidence une base génétique réduite au sein de ce programme qui s'était alors orienté vers une sélection intra-familiale. Devant la lourdeur zootechnique d'un tel schéma, un compromis a été trouvé en réalisant une sélection au sein de cohortes de familles biparentales, la gestion de ces cohortes étant permise par les analyses moléculaires. Le programme est maintenant dans sa phase de transfert, avec des expérimentations à plus grande échelle en partenariat avec la profession. En ce qui concerne l'huître creuse, et en parallèle de l'obtention et l'étude de polyploïdes, les performances de différentes souches d'huîtres creuses provenant d'Asie ont été comparées à celles de la souche introduite en France il y a trente ans, sujette à des mortalités estivales. La souche locale présente de meilleures performances, vraisemblablement grâce à une adaptation bien réalisée. Par ailleurs, bien que l'amélioration de la croissance jusqu'à la taille commerciale s'avère possible par une sélection précoce au stade larvaire, le critère de croissance n'est pas nécessairement à privilégier dans le contexte d'un bassin ostréicole disposant de ressources trophiques limitées. En revanche, les importantes mortalités rencontrées par le naissain en périodes estivales constituent le sujet d'étude prioritaire sur lequel se sont penchées de nombreuses équipes (génétique, physiologie, pathologie, écologie, ...) dans le cadre du grand défi MOREST. Les premiers résultats ont mis en évidence de fortes différences de survie entre des familles biparentales d'animaux indiquant un déterminisme génétique du caractère « survie », et encourageant dans la voie d'une sélection pour ce caractère.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3491.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3491/

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : This paper is a part of a study concerned with shellfish culture in France. Before presenting improvements in technique, the author gives fundamentals of the biology of oyster and mussels taxonomy and anatomy, respiration, feeding, reproduction, growth, predators and diseases.
SOMMAIRE ------------------ L'HUITRE ------------------ INTRODUCTION CHAPITRE I. TAXONOIVIIE ET ANATOMIE DES HUITRES 1. Taxonomie des huîtres vivant dans ie monde Introduction et rappel historique Les genres (Pycnodonta, Crassostrea, Ostrea) Les principales espèces et leur répartition dans le monde 2. Anatomie de l'huître La coquille Le corps BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE II - LE TRANSPORT DE L'EAU ET LA RESPIRATION 1. Le transport de l'eau . Mécanisme Méthodes de mesure du courant de transnort Quantités d'eau transportées 2. La respiration 3. L'anaérobiose . BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE III. ALIMENTATION ET VERDISSEMENT DES COQUILLAGES 1. Alimentation des coquillages Anatomic des « coquillages » et leur alimentation 1. La collecte des particules alimentaires 2. L'appareil digestif: et la digestion Besoins alimentaires 1. Besoins quantitatifs 2. Nature des aliments. Besoins qualitatifs Conclusion générale 2. Le verdissement Le verdissement. Biologie de Navicula ostrearia La navicule des huîtres, agent du verdissement Le verdissement dans les claires L'écologie des claires en rapport avec la définition du verdissement Données récentes sur la genèse du verdisîsement La navicule bleue de l'huître : ultrastructure du frustule, cytologie, développement . . Derniers résultats sur les conditions d'apparition et de maintien du verdissement en cultures in vitro et en claires Conclusion BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE IV. - LA REPRODUCTION Généralités Anatomie des organes de reproduction La sexualité des huîtres La ponte Incubation et émission des larves Fécondité Rythmes sexuels, influence du milieu Les rythmes Périodicité et durée des émissions de gamètes Influence du milieu OEufs et larves Influence de l'environnement sur la vie larvaire Métamorphose et fixation BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE V. LES ENNEMIS DE L'HUITRE ET DE L'OSTREICULTURE Les prédateurs Le ver plat, Stylochus sp Les bigorneaux perceurs Autres gastéropodes prédateurs Les pieuvres Les crustacés Les échinodevmes Les poissons Les oiseaux Les compétiteurs Animaux Végétaux Le chambrage BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE VI. - MALADIES ET MORTALITES 1. Maladies parasitaires Parasites divers Grégarines Trématodes Cestodes Copépodes Maladies à caractère endémique ou épidémique Les viroses Les champignons La maladie des branchies Les flagellés ; Hexamita sp Les haplosporidies La maladie de la glande digestive de l'huître plate et son agent, Marteilia refringens La maladie de Malpèque 2. Mortalités d'origines diverses Variations excessives de la température Variations excessives de la salinité Eutrophisation Mortalités du Belon Mortalité massive de la baie de Matsushima BIBLIOGRAPHIE ------------------ LA MOULE ------------------ TaxonoiTiie La coquille Le corps Alimentation. Croissance. Engraissement La filtration Mécanisme . . . . Action de la température, de la salinité et de l'oxygène dissous Durée journalière Vitesse de filtration Les éléments nutritifs La digestion La croissance L'engraissement La reproduction Glande génitale et sexe Evolution de la gonade Description des phénomènes Facteurs influençant l'évolution de la gonade Emission des produits génitaux Description du phénomène Facteurs influençant l'émission des produits génitaux Vie larvaire Développement de la larve, sa métamorphose Taille des larves Comportement des larves Action de différents facteurs sur la vie des larves Fixation Résumé Les ennemis Prédateurs Compétiteurs Parasites Causes diverses de mortalité BIBLIOGRAPHIE
Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1976-06 , Vol. 40 , N. 2 , P. 149-346

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1976/publication-1796.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1796/

Éditeur(s) : INRA
Résumé : According to the world organisation for animal health (OIE) an emerging disease is defined as a recently admitted serious illness, whose aetiology can, or not, have already been established, and which is likely to be propagated within a population or between populations, for example at the time of international exchanges of aquatic animals and/or products of aquatic animals. Even though the emerging diseases that affect human health have been much studied, those which affect marine organisms and species of aquaculture interest in particular are poorly documented. By restricting emergence to only infectious diseases, we aim at presenting in a non-exhaustive way some scenarios of the emergence of the diseases of aquacultured species by illustrating them with three examples available in the scientific literature: one relating to the appearance of a pathogenic agent in a new host with the case of the herpesvirus of the Koï carp, the other with the evolution of a pre-existing pathogenic agent with the case of shrimp vibriosis due to Vibrio nigripulchritudo in New Caledonia, and the last example relating to the introduction of one pathogenic pre-existing pathogen in an unscathed area with the case of Bonamia ostreae infecting the flat oyster Ostrea edulis. The causes of the emergence of diseases are multiple and implicate in an intercurrent way pathogenic agents, the environment, the host or host species and anthropogenic factors. In the marine environment, these causes are very often ignored. In this context, the development of zoosanitary surveillance networks and diagnostic tools present a considerable interest in order to anticipate, prevent and/or intervene on the emergence of the diseases by limiting their sanitary, ecological and political consequences.
Selon l'Office International des Epizooties (OIE) une maladie émergente désigne une maladie grave récemment reconnue, dont la cause peut, ou non, avoir déjà été établie, et qui est susceptible de se propager au sein d'une population ou entre des populations, par exemple à l'occasion d'échanges internationaux d'animaux aquatiques et/ou de produits d'animaux aquatiques. Si les maladies émergentes qui affectent la santé humaine ont été très étudiées, celles qui touchent les organismes marins et les organismes aquacoles d'intérêt économique en particulier sont en revanche peu documentées. C'est en restreignant l'émergence aux seules maladies infectieuses que seront présentés de façon non exhaustive quelques scénarios de l'émergence des maladies chez les organismes d'intérêt aquacole en les illustrant par trois exemples disponibles dans la littérature scientifique : l'un relatif à l'apparition d'un agent pathogène chez un nouvel hôte avec le cas de l'herpesvirus de la carpe Koï, l'autre à l'évolution d'un agent pathogène existant avec le cas de la vibriose à Vibrio nigripulchritudo sévissant dans les élevages de crevettes pénéides de Nouvelle-Calédonie et enfin le dernier lié à l'introduction d'un pathogène préexistant avec le cas de Bonamia ostreae infectant l'huître plate Ostrea edulis. Les causes d'émergence de maladies sont multiples et font intervenir de façon intercurrente l'agent pathogène, l'environnement, l'hôte ou les espèces hôtes et des facteurs anthropiques. Dans le milieu marin, ces causes sont bien souvent méconnues. Dans ce contexte le développement des réseaux de surveillance et des techniques de diagnostic revêtent un intérêt considérable afin d'anticiper, de prévenir et/ou d'intervenir sur l'émergence des maladies en limitant leur conséquences sanitaires, écologiques et politiques.
INRA Productions Animales (INRA), 2007-07 , Vol. 20 , N. 3 , P. 207-212

Droits : INRA
http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2980.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2980/

Éditeur(s) : Actes de colloques. Ifremer. Brest [ACTES COLLOQ. IFREMER.]. 1985
Résumé : SATMAR has developed techniques and methods allowing a production of over 100 million spat per year at a size from 2 to 10 millimetres. Among the 13 species concerned by this production, 3 of major importance are the oysters Crassostrea gigas, Ostrea edulis and the Japanese little neck clam, Ruditapes philippinarum . The hatchery production could easily be doubled if the market would increase. Current research tend to increase the quality of the products by means of genetics and to lower the costs by improving the nursery phase.
La Société Atlantique de Mariculture a développé des techniques et des méthodes permettant la production annuelle de plus de l00 millions de naissains d'une taille de 2 à 10 millimètres. Parmi les 13 espèces concernées par ces productions les 3 principales sont les huîtres Crassostrea gigas, Ostrea edulis, et la palourde du Pacifique, Ruditapes philippinarum. La production de l'écloserie pourrait facilement doubler si le marchess développait. Les recherches actuelles portent sur l'amélioration de la qualité des produits par la sélection génétique et un abaissement du prix de revient par l'optimisation des performances au niveau de la phase nurserie.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1983/acte-1184.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1184/

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : Shell is the basis of the distinction between the different species of molluscs. But the elements defining the shape and colour of the shell can vary according to the environmental conditions. So much so that, in numerous cases, a whole range of intermediates can be found between two species. Among molluscs, oysters are considered as a particularly confused group. Their shells are indeed extremely variable. All sorts of intermediates can be found. They usually attach themselves using their bottom valve, and, depending on the shape of the substrate, salinity conditions, temperature, outside environment, they present a wide range of individual variations. I had the opportunity to examine the larval shells of some of our coastal species. I noticed that each species had a specific prodissoconch, with a constant shape and no fundamental individual variations, an understandable fact given their planktonic life. The hinge and the position of the ligament in the hinge enable the definition of their genus. During the study of the collections of oysters from some of the world's most renowned museum (1), I tried to isolate the prodissoconches of the different species. I found them attached to the adult shells, making sure that all the prodissoconches attached to the top of the adult shells showed the same morphological characteristics. (unverified OCR)
LAMARCK, en 1806, dans l'ouverture de son Cours sur les «Animaux sans Vertèbres», s'exprimait ainsi : «En attendant, souvenons-nous que rien de tout cela n'est dans la nature, qu'elle ne connaît ni Classes, ni Ordres, ni Genres, ni Espèces, malgré le fondement que paraissent leur donner les portions de la série naturelle que nous offrent nos collections et que parmi les corps organisés, il n'y a réellement que des individus et des races diverses qui se nuancent dans tous les degrés de l'organisation. » Ainsi, pour LAMARCK, les cadres de la Classification zoologique seraient artificiels, ce seraient des créations de l'esprit, ayant seulement pour but de faciliter l'étude du monde vivant. Effectivement lorsqu'on consulte, comme je l'ai fait, les «Collections Lamarck» des Musées de Paris et de Genève. on s'aperçoit que, pour LAMARCK, le moindre caractère morphologique qui différencie une coquille de Mollusque d'une autre est une entité. Il multipliait le nombre des espèces et créait des variétés. Pour CUVIER (2) : «Le travail des nomenclatures, besogne facile, qui ne demande aucune intelligence a fait négliger la science véritable.» Et dit-il, ailleurs (:1) : «Après tout je n'ai pas jeté cette esquisse de division pour servir aux commençans à trouver les noms des espèces; qu'ils emploient pour cela tel système artificiel qu'ils trouveront le plus facile; cela est juste... » Les systèmes en question ne seraient donc que jeux de l'esprit, pour CUVIER également. Notre pensée a beaucoup évolué depuis cette époque. Nous pouvons dire maintenant que la Vie est la manière d'être des protéines et qu'il existe autant de protéines que d'espèces. Dès 1912, Jacques LOEB disait (4) : «Qu'en toute certitude, chaque animal a des substances germinatives spécifiques et que les substances germinatives diffèrent chimiquement d'un animal à l'autre, Les qualités chimiques d'un oeuf de poulet font qu'il ne peut donner naissance qu'à un poulet.» La notion d'espèce chimique vivante nous entraîne, par ailleurs, vers une nouvelle conception des autres groupes de la classification. L'individu porteur de caractères particuliers par lesquels il peut seulement être défini, est aussi porteur d'un noyau protoplasmique spécifique et enfin d'autres, propres successivement à la famille, à l'ordre, à la classe et à l'embranchement dont il fait partie. Cela est très important, car toutes ces catégories de la classification zoologique ne nous apparaissent plus alors comme de simples entités, subjectives, formelles, mais comme ayant effectivement une réalité précise dans le monde extérieur. La recherche et la définition correcte des espèces apparaissent alors comme un travail de première importance. Lorsqu'on poursuit des recherches embryologiques, physiologiques, biologiques ou autres sur un organisme, il est indispensable de savoir d'une manière précise en présence de quelle espèce on se trouve. Par ailleurs, comment parler de l'évolution des espèces si leur existence objective n'est pas admise et si elles ne sont pas correctement définies? Toute l'histoire de la Zoologie est marquée par l'effort constant de préciser les caractères de l'espèce et d'en faire une réalité objective. Chez les Mollusques, la coquille a servi de base essentielle pour la distinction des espèces. Mais les éléments de la forme et de la couleur de la coquille varient avec les conditions du milieu de telle sorte qu'on trouve dans de nombreux cas, tous les intermédiaires entre deux espèces. Parmi les Mollusques, les Huîtres constituaient un groupe particulièrement confus. En effet, leurs coquilles sont extrêmement variables. On rencontre tous les intermédiaires. Elles se fixent le plus souvent sur un support par la valve inférieure et là selon la forme du support, selon les conditions de la salinité, de la température, du milieu extérieur, elles présentent une immense gamme de variations individuelles. J'ai été amené à examiner les coquilles larvaires de quelques espèces de nos côtes. J'ai constaté que chaque espèce avait une prodissoconque particulière, d'une forme constante et sans variations individuelles fondamentales ce qui se conçoit aisément, étant donné leur vie planctonique. Leur charnière et la position du ligament par rapport à cette dernière, permettent de définir les genres, En étudiant les collections d'Huîtres des grands musées du monde (1), j'ai cherché à isoler les prodissoconques des diverses espèces. Je les ai trouvées sur les coquilles adultes où elles s'étaient fixées. m'assurant chaque fois que les prodissoconques conservées au sommet des coquilles adultes présentaient les mêmes caractéristiques morphologiques. J'ai microphotographié la plupart des coquilles larvaires étudiées. Ce sont les épreuves qui sont reproduites ici. J'en ai fait faire des dessins au trait et pour quelques-unes dont les microphotographies manquent, on trouvera les dessins au trait réalisé à la chambre claire. Chaque espèce est bien définie par sa coquille larvaire. La meilleure démonstration en est fournie par les deux espèces. si voisines par leurs coquilles adultes, Ostrea edulis et Ostrea chilensis; leurs prodissoconques sont spectaculairement différentes. Je remercie Monsieur le Directeur de l'Institut scientifique et technique des Pêches maritimes qui a bien voulu accepter de publier le résultat de ces recherches dans la belle Revue des Travaux de son Institut. (OCR non contrôlé)
Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1967-06 , Vol. 31 , N. 2 , P. 127-199

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1967/publication-3761.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3761/

Éditeur(s) : Université des Sciences et Techniques du Languedoc, Montpellier
Résumé : On étudie les parasitoses à Marteilia refringens et à Haplosporidium armoricanum de l’huître plate européenne Ostrea edulis. L’étude de M. refringens précise certains aspects de la biologie de l’agent infectieux. Elle montre que les modalités du cycle de développement du parasite et l‘ultrastructure des stades les plus évolués de la sporogenèse peuvent être modifiées selon les conditions hydrobiologiques du milieu dans lequel est cultivé l’hôte. Elle établi que l’action du parasite conduit à la destruction des épithéliums digestifs de l’huître et s’exerce en interférant avec le métabolisme protéique d’O. edulis. Elle précise l‘ultrastructure des cellules impliquées dans des proliférations hémocytaires atypiques associées à la parasitose et établit la nature néoplasique du phénomène. L’étiologie de l’hémocytose n’est toutefois pas déterminée. Enfin elle met en évidence un cas d‘hyperparasitisme de M. refringens par une Microsporidie. L’étude ultrastructurale de la sporogenèse et des effets pathogènes du Protozoaire vis à vis de l’hôte nous conduit à identifier l’hyperparasite comme Nosema ormieresi et montre que certains stade de M. refringens peuvent être fortement altérés par l’infestation microsporidienne. L’étude d’une Haplosporidie observée chez O. edulis du bassin d’Arcachon (France) nous amène à comparer la sporagenèse du parasite avec celle d’autres Haplosporidies d’invertébrés marins. Les caractéristiques de la spore nous incitent à inclure le parasite dans le genre Haplosporidium et le rapprochement du Protozoaire avec Minchinia armoricana conduit à l’identifier comme Haplosporidium armoricanum. L’étude de la pathogenèse des infections à M. refringens et à H. armoricanum permet de préciser les relations entre les parasites étudiés et leur hôte commun l’huître plate et les interactions hôte-parasite-milieu pouvant intervenir dans le caractère des deux maladies.

Droits : The Author, Univ. Montpellier, ISTPM
http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19411/17022.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19411/

Résumé : La convention renouvelée en 1993 avec la Région Bretagne a contribué à la poursuite des recherches dans le cadre du Plan de Relance de l'huître plate Ostrea edulis. Ce rapport présente les travaux réalisés et les résultats acquis durant l'année 1993, aussi bien en ce qui concerne le suivi des élevages que dans le domaine de la génétique.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00081/19206/16801.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00081/19206/

Éditeur(s) : Paris : Madaran
Résumé : Traduction de : Reise nach Guinea und den Caribäischen Inseln in Columbien ; in Briefen an seine Freunde beschrieben
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG17025
ADG17025

Éditeur(s) : World Aquaculture Society, Aquaculture 2006
Résumé : Oysters are among the most familiar of all marine invertebrate taxa. However our knowledge of oyster phylogeny and systematics is fragmentary. This is principally due to the plastic growth patterns of these animals, which result in a wide range of overlapping, ecophenotypic variants that greatly reduce the value of analysis based on shell morphology. Besides that, many intentional or accidental anthropogenic transfers have emphasised this situation. In several cases of misclassification or misidentification of oysters, DNA molecular data, have provided valuable new insights on the tracing of introductions or more generally on the phylogeographic relationships between oyster species. We will illustrate this issue with recent case studies from our lab on several flat and cupped oysters: (1) the Crassostrea gigas – Crassostrea angulata couple of Asian species and their successive introductions in Europe, (2) the new species of cupped oysters, Crassostrea honkongensis, described in Hong-Kong and very divergent from the species Crassostrea gigas it was initially supposed to be, (3) the mangrove oyster Crassostrea gasar that was shown not only to be present along the coasts of Western Africa but also along the Atlantic coasts of South America, and (4) the geographic disjunction between Ostreola stentina, described in the Mediterranean Sea, and the genetically closely related species Ostrea aupouria (from New Zealand) and Ostreola equestris (from Mexico Gulf/Atlantic). At the intra specific level, we will focus on one of the main documented case in Europe, the flat oyster, Ostrea edulis. It is a marine bivalve whose natural geographical distribution ranges along the European Atlantic coast from Norway to Morocco, in addition to the Mediterranean and Black Sea. Studies of allozymes, microsatellites and mitochondrial differentiation over the whole range concluded that a significant divergence existed between Mediterranean and Atlantic populations, together with an isolation-by-distance pattern. However, the average mitochondrial haplotypic diversity displayed a high among populations variance, reflecting smaller effective population size in some locations. Additionally, a ten-fold quantitative difference was observed in the same study in Fst between the mitochondrial and the nuclear genomes, which could be due to sex biased differential reproductive success between males and females. In order to further document this hypothesis, two experiments at the population level were conducted. First, brooding females were sampled in a wild population and the number of males fertilizing a given female estimated. Then, parentage analyses were achieved under experimental conditions: successive mass spawnings were collected from a population of potential genitors kept in hatchery, whose genotypes were known, in order to infer a posteriori the relative contribution of each genitor. Moreover, we aimed to better understand the reproduction dynamics of this species. Several patterns of spawning could be distinguished: unique, successive or extended in time. The different parental contributions and reproductive behaviors observed in these experiments are discussed in the context of the hypothesis of a variance in the reproductive success of males and females and consequences in local and temporal reduced effective population sizes.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-3475.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3475/

Résumé : Il existe à l'état sauvage deux espèces d'huîtres aux Antilles, Ostrea frons et Crassostrea rhizophorae. Toutes deux se reproduisent tout au long de l'année et constituent en différents endroits des gisements d'importance variable. La première appartient à la catégorie des "plates" et vit dans la zone infralittorale mais sa taille excessivement réduite, 4 cm de diamètre au plus, ne permet pas de l'exploiter. La seconde que l'on range parmi les "creuses", constitue d'importants gisements dans la zone de balancement des marées, principalement au niveau des racines-échasses des palétuviers d'où son nom d'huître de palétuvier. Sa taille, son aspect et son goût font qu'élle est cueillie et consommée depuis longtemps. En 1971, des recherches ont été entreprises par le laboratoire ISTPM de la Martinique en vue de créer une activité ostréicole aux Antilles. Les premières études menées jusqu'en 1975 sur l'huître de palétuvier locale ont permis de constater la médiocrité persistante des résultats des élevages expérimentaux ; ceci a conduit à orienter les travaux sur l'implantation d'espèces étrangères, en commençant par l'huître japonaise Crassostrea gigas. En 1976 les essais d'acclimatation ont intéressé l'huître plate Ostrea edulis, importée de Bretagne, l'huître de palétuvier Crassostrea rhizophorae provenant de Guyane, ainsi qué les moules Mytilus edulis et Mytilus galloprovincialis. Après avoir rappelé brièvementquelques caractéristiques de l'huître de palétuvier des Antilles,nous décrirons les essais d'élevage réalisés avec ce coquillage local puis ceux effectués avec des espèces étrangères.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00046/15699/13101.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00046/15699/